Όσον αφορά την επιστημονική ταυτότητα και ιδιοπροσωπία της Σχολής Κλασικών και Ανθρωπιστικών Σπουδών,σημειώνεται ότι κύριο έργο της είναι η εξέταση του ανθρώπου και των έργων του στη διαχρονία (αρχαιότητα – μεσαίωνας – νεότεροι χρόνοι – σύγχρονη εποχή) με τοπική έμφαση στη Νοτιοανατολική Ευρώπη, στη Μέση Ανατολή και στην ανατολική λεκάνη της Μεσογείου. Επίσης, κεντρικός της στόχος είναι η ανάπτυξη των Νεοελληνικών Σπουδών, δηλαδή η μελέτη του Νέου Ελληνισμού και του νεοελληνικού πολιτισμού σε όλες τις εκφάνσεις του από την Άλωση της Κωνσταντινούπολης μέχρι σήμερα (γλώσσα, λογοτεχνία και γραμματεία, συγκριτική φιλολογία, ιστορία, λαογραφία, κοινωνική ανθρωπολογία, αρχειονομία, πολιτισμικές σπουδές, ιστορία της τέχνης και των ιδεών και άλλα πεδία των ανθρωπιστικών επιστημών με επίκεντρο την πολιτισμική διάσταση του Νέου Ελληνισμού).