Η Διεύθυνση Οικονομικής Διαχείρισης έχει την ευθύνη για την εύρυθμη και ομαλή λειτουργία των οικονομικών υπηρεσιών, τη διασφάλιση της χρηστής δημοσιονομικής διαχείρισης, την κατάρτιση και ορθή εκτέλεση του προϋπολογισμού του φορέα, τη λογιστική αποτύπωση των δραστηριοτήτων του φορέα σύμφωνα με τη σχετική νομοθεσία και τις οδηγίες του Γ.Λ.Κ. και το συντονισμό των ενεργειών που απαιτούνται για την αποτελεσματική διαχείριση των πόρων του Δ.Π.Θ. Επίσης επιλαμβάνεται των πάσης φύσεως προμηθειών του Ιδρύματος, έχει την ευθύνη για την έγκαιρη προμήθεια και την αποδοτική αξιοποίηση των αναγκαίων για την ομαλή λειτουργία του Ιδρύματος ειδών και υπηρεσιών.