Το ΠΜΣ «Υδραυλική Μηχανική και Περιβάλλον» λειτουργεί 30 σχεδόν έτη και αναγνωρίζεται ως ένα από τα πιο ολοκληρωμένα ΠΜΣ στο πεδίο της υδραυλικής μηχανικής και της διαχείρισης περιβάλλοντος. Έχει μικρή χρονική διάρκεια (1 πλήρες έτος) και 75 ECTS. Συμπεριλαμβάνεται στις προκηρύξεις του ΑΣΕΠ. Η εκπαίδευση γίνεται με σύγχρονη εξ αποστάσεως διδασκαλία, απογευματινές ώρες, ώστε να το παρακολουθούν εργαζόμενοι. Περιλαμβάνει τρεις εσωτερικές ειδικεύσεις σπουδών: Α) Υδραυλικά Έργα και Περιβάλλον, Β) Διαχείριση Υδατικών Πόρων και Φυσικών Καταστροφών, Γ) Θαλάσσια Έργα και Περιβάλλον. Κύριοι στόχοι του ΠΜΣ είναι:
Η υψηλού επιπέδου μεταπτυχιακή εκπαίδευση, η προαγωγή της επιστημονικής έρευνας και η εξειδίκευση για την παραγωγή νέας γνώσης,
Η αποτελεσματικότερη αντιμετώπιση των αναγκών της χώρας σε τεχνικά έργα Πολιτικού Μηχανικού σε σχέση με την υδραυλική μηχανική και το περιβάλλον, με την παραγωγή εξειδικευμένων αποφοίτων με τεχνικές και δεξιότητες σχετικές με τον σχεδιασμό και υλοποίηση υδραυλικών, υδροενεργειακών, λιμενικών και παράκτιων έργων και έργων διαχείρισης υδατικών πόρων.