Βασικός στόχος του Π.Μ.Σ. είναι να προάγει την επιστημονική γνώση και την έρευνα πάνω στο Ποινικό Δίκαιο, την Ποινική Δικονομία και τις εγκληματολογικές επιστήμες και να δώσει στους μεταπτυχιακούς φοιτητές μια ολοκληρωμένη εικόνα των αρχών, των πρακτικών και των τεχνικών του Ουσιαστικού Ποινικού Δικαίου, του Δικονομικού Ποινικού Δικαίου και των Εγκληματολογικών Επιστημών, με έμφαση στην αλληλεπίδραση θεωρίας και πράξης, μέσω της εμβάθυνσης στις σημαντικότερες θεματικές των παραπάνω γνωστικών αντικειμένων, συμβάλλοντας στην επιμόρφωση δικηγόρων, δικαστών και εισαγγελέων, στη διάχυση της γνώσης σε ένα ευρύτερο επιστημονικό κοινό μέσω διοργάνωσης συνεδρίων, ημερίδων και διαλέξεων, στην ανάπτυξη της έρευνας και της καινοτομίας σε ειδικές θεματικές ενότητες, και στην παροχή γνώσεων, ικανοτήτων και δεξιοτήτων που απαιτούνται για σπουδές σε διδακτορικό επίπεδο.