Η Yπηρεσία Διασφάλισης Ποιότητας (ΥΔΠ) είναι υπεύθυνη για τη διασφάλιση ποιότητας εντός του οργανισμού. Τα καθήκοντά της περιλαμβάνουν την εκτέλεση αποφάσεων και τη γραμματειακή υποστήριξη της ΕΔΠ-ΔΠΘ, καθώς και την υποβολή εισηγήσεων και προετοιμασία υλικών για λήψη αποφάσεων. Συνεργάζεται με την ΕΘΑΑΕ για διαδικασίες αξιολόγησης και πιστοποίησης, αναπτύσσει και παρακολουθεί το Εσωτερικό Σύστημα Διασφάλισης Ποιότητας (ΕΣΔΠ) του ιδρύματος και συντονίζει τις διαδικασίες πιστοποίησης όλων των Προγραμμάτων Σπουδών του Ιδρύματος. Επίσης, συλλέγει και επεξεργάζεται δεδομένα ποιότητας, δημοσιοποιεί πληροφορίες αξιολόγησης στον ιστότοπο του ιδρύματος και είναι υπεύθυνη για την συλλογή των δεικτών της έκθεσης ποιοτικής αποτίμησης επιτευγμάτων που συνδέεται με τη χρηματοδότηση του ιδρύματος. Διατηρεί πληροφοριακό σύστημα διασυνδεδεμένο με τα λοιπά Πληροφοριακά Συστήματα του ιδρύματος και το ΟΠΕΣΠ της ΕΘΑΑΕ, επικοινωνεί με τις Ομάδες Εσωτερικής Αξιολόγησης, αναλύει εκθέσεις πιστοποίησης, τηρεί αρχεία, προωθεί δράσεις ποιότητας και διοργανώνει εκπαιδευτικές δραστηριότητες.