H Εκτελεστική Διευθύντρια του Δ.Π.Θ. προΐσταται των οργανικών μονάδων του ιδρύματος και του προσωπικού τους (με εξαίρεση τη Μονάδα Εσωτερικού Ελέγχου), συντονίζει και εποπτεύει το έργο τους, μεριμνά για την ομαλή και αποτελεσματική διοικητική και οικονομική λειτουργία του Δ.Π.Θ., την εφαρμογή του στρατηγικού σχεδίου και της ετήσιας στοχοθεσίας του και συνεργάζεται με τους προϊσταμένους και το λοιπό προσωπικό των οργανικών μονάδων του Δ.Π.Θ. με σκοπό την εκπλήρωση της αποστολής του.